化療費用主要包括藥物費用、治療器械設備費用、醫用材料類費用。其中部分藥物費用可以通過醫保報銷，但是化療過程中產生的治療器械設備費用和醫用材料類費用不可以報銷。

使用國家醫保藥品目錄中的化療藥物可以申請報銷，不在目錄內的藥品費用不能報銷，比如進口藥和營養品，并且同樣的藥品通過城鎮醫保和新農合報銷的比例也有所不同。