汽車自燃保險公司是否賠付，需要看有沒有購買自燃險。如果汽車自燃沒有買自燃險，保險公司是不賠的。如果汽車買了自燃險，保險公司會根據實際情況進行理賠。

在綜合車改后，自燃險是屬于機動車車輛損失保險的一個附加險種，保障內容跟以前是一致的，保障的是由車輛電路、線路、油路、供油系統、貨物自身發生問題、機動車運轉摩擦起火而引發的火災，從而導致保險車輛的損失。還可以保障被保險人在發生保險事故時，為減少保險車輛損失而支付的合理施救費用。

但是不是所有情況的自燃險都會賠的，不賠的情況包括了：

1、自燃僅造成電器、線路、油路、供油系統以及供氣系統損失的。

2、擅自改裝，加裝電器及設備導致被保車輛起火造成的損失。

3、在使用被保車輛過程中，因違反車輛安全操作規則造成的損失。