城鎮醫療和農村合作醫療的區別為：

1.參保人不同，城鎮醫療（即職工醫保）是由職工參保，保費由用人單位和職工共同繳納，而農村合作醫療（即新農合）主要由農民朋友們參保，是一種互助共濟的醫療制度，也屬于國家醫保；

2.城鎮醫療所需要繳納的保費相對于農村合作醫療來說要高一些；

3.城鎮醫療所能報銷的費用相對于農村合作醫療來說要高一些；

4.農村合作醫療的起付線相對于城鎮醫療來說要低一些。