ATM機與銀行之間沒有開通存款相容的業務，所以ATM只能本行存本行的，有些銀行ATM也不能跨省跨地區存只能存本地區的，跨省跨地區要存只能上本行柜臺存，例于山東省農村商業銀行ATM只能存本地區，跨地區，跨省只能上柜臺，省內不要手續費，跨省要收一定的手續費。

自動存款機本身沒有限額，但會因為用戶轉入賬戶的限額而限額，例如招行一卡通和信用卡可以通過招行存款機**有卡、無卡存款，具體限額如下：
1、一卡通:無卡存款一天限額5萬，有卡存款無限額；
2、信用卡:無卡存款一天限額2萬，有卡存款無限額。
用戶需注意，在銀行柜臺存款沒有最高額度限制，但在柜臺存款5萬以上需帶存款人身份證。雖然ATM機存款次數不限，但每一臺自助存款機的鈔箱都有大小限制，一般而言只會留1到2個鈔箱作存款鈔箱，每個鈔箱根據自助存款機類型不同，可放20-25萬人民幣。一般自助存款機有4-5個鈔箱，極端情況，一臺空置的自助存款機最多可存125萬元人民幣。因此用戶若存入資金時恰好達到自助存款機可存金額上限也會導致存款失敗。
大多數銀行的大部分ATM自助存取款機單日累計取款限額為2萬元，這是央行規定的單日最大取款金額。在單日最大取款金額不變的前提下，不同銀行對單筆取款的金額是有限制的。